2024年11月4日,国际化学类顶级期刊《德国应用化学国际版》(Angewandte Chemie-international Edition)(IF 16.1)上发表了题为《LAMP-MS for Locus-Specific Visual Quantification of DNA 5mC and RNA m6A Using Ultra-Low Input》的研究论文。报道了一种基于核酸质谱平台的创新甲基化检测方法,该工作由复旦大学医学院胡璐璐研究员团队、华山医院消化科刘杰主任团队、美国芝加哥大学何川院士团队携手柏锘(上海)医疗科技有限公司共同完成。 该研究中所使用的飞行时间质谱平台为管家婆黄大仙资料大全生命科学板块旗下聚致生物(GenWish)自主研发的GeneTOF 3100核酸质谱分析系统。 液体活检技术通过收集血液中来自各种组织的游离DNA(cfDNA),对其中包含的生物标志物(如基因突变、甲基化或羟甲基等表观修饰)进行检测,具有无创、高效的特点。与传统的各种检测技术(例如胃肠镜、血清标志物)相比,液体活检在临床上具有革命性的优势,在癌症等疾病的早筛早诊、预后监测、疗效评估等诸多方面有广阔的应用前景。 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,可在肿瘤发生的早期被检测到,且具有较好的稳定性,因此成为肿瘤液体活检中一个极具价值的生物标志物。但是,目前基于亚硫酸氢盐测序技术的甲基化检测方法,很难避免DNA的降解;且高通量测序成本较高,实验后的分析工作复杂;PCR检测涵盖的位点也有限,因此开发一种经济、可靠、通量灵活且能够覆盖多位点的新甲基化检测方法,是非常具有意义的。 研究团队开发的LAMP-MS方法创造性地将线性扩增和飞行时间质谱技术结合在一起,只需要1ng血浆cfDNA,通过多重PCR和单碱基引物延伸,能够在较短时间内同时检测数十个甲基化位点。该技术主要操作步骤如图1所示: LAMP-MS的完整工作流程